Loại ruồi cống thường thấy trong phòng tắm, Clogmia albipunctata, không được biết là truyền bệnh con người, nhưng có thể tấn công cơ hội vào vết thương hở. Trường hợp ấu trùng ruồi cống sống trong họng đã được quan sát ở Việt Nam.[1] Phân họ Phlebotominae hút máu với khả năng truyền bệnh (nhiệt đới) và Sycorax silacea có thể truyền vi khuẩn microfilaria.[11] Hít phải mảnh của ruồi cống có thể gây hen.

Kiểm soát

Cách tốt nhất để kiểm soát ruồi cống là loại bỏ nơi sinh sản của chúng, ví dụ vật liệu hữu cơ bị mắc kẹt trong cống. Sau khi loại bỏ rác, ấu trùng không còn nhưng ruồi trưởng thành vẫn sống khoảng 20 ngày.